To ta jednostka jest odpowiedzialna za niezakłóconą komunikację, przydział częstotliwości fal radiowych w resorcie obrony narodowej, współpracuje z organizacjami międzynarodowymi i krajowymi w zakresie gospodarowania częstotliwościami. Dodatkowo WBZC szkoli, w trakcie specjalistycznych warsztatów i treningów, specjalistów od zarządzania falami radiowymi.

Jednostka jest jedyną w kraju, wyspecjalizowaną instytucją wojskową, która organizuje dostęp do widma elektromagnetycznego i zarządza częstotliwościami, a także zapewnia warunki do bezpiecznej i niezakłóconej pracy wojskowych systemów radioelektronicznych, w tym ich ochrony przed cyberzagrożeniami w środowisku elektromagnetycznym. Dotyczy to wojskowych systemów radioelektronicznych takich jak systemy radiokomunikacyjne, radiolokacyjne, identyfikacji bojowej oraz systemy rażenia dla Sił Zbrojnych RP (SZ RP) oraz wojsk sojuszniczych przebywających na terytorium Rzeczypospolitej Polskiej.

WBZC działa w obszarze tzw. wysokich technologii wymagających użycia energii elektromagnetycznej w różnorakich obszarach, w tym głównie radiokomunikacji, radiolokacji oraz radionawigacji w celu zapewnienia SZ RP przewagi informacyjnej tj. dominacji w środowisku informacyjnym. Jest to możliwe tylko w wyniku synergii z aktywnością Sił Zbrojnych RP w cyberprzestrzeni.

WBZC historycznie wywodzi się ze służby łączności, w szczególności służby radiokomunikacyjnej (radiotelegraficznej). W Wojsku Polskim służba ta zaczęła funkcjonować od momentu uzyskania niepodległości, a radiostacja przejęta w warszawskiej Cytadeli była tym narzędziem, dzięki któremu świat dowiedział się o odrodzeniu Państwa Polskiego.

Biuro przyjęło tradycje Pułku Radiotelegraficznego, który w okresie II Rzeczypospolitej był jednostką o unikalnych kompetencjach. Skupiał wiedzę i środki niezbędne do rozwijania nowoczesnej, jak na tamte czasy, łączności radiowej w Wojsku Polskim. Patronem WBZC jest ostatni Dowódca Pułku śp. płk Mieczysław Ornatowski (1894-1940), wybitnego oficera łączności, zginą zamordowany w lesie katyńskim w kwietniu 1940 r.

Symbolem rozpoznawczym noszonym na mundurach i beretach przez żołnierzy służących w WBZC są litery SR (spektrum radiowe), natomiast odznaką pamiątkową jest modyfikacja oryginalnej odznaki pułkowej Pułku Radiotelegraficznego stacjonującego w okresie międzywojennym na warszawskich Powązkach.

Wojskowe Biuro Zarządzania Częstotliwościami (WBZC) w Warszawie zostało powołane z dniem 1 kwietnia 1999 r. decyzją Nr 2/MON Ministra Obrony Narodowej. Utworzenie Biura było jednym z warunków akcesji Polski do Sojuszu Północnoatlantyckiego, objęte zostało celem nr TG 2786, stąd w strukturze Sojuszu Biuro pełni rolę NARFA POL (ang. National Radio Frequency Agency Poland).