Wojskowy Ośrodek Szkoleniowo - Kondycyjny w Zakopanem w ramach codziennego funkcjonowania realizuje:

• turnusy szkoleniowo-kondycyjne dla personelu latającego SZ RP;
• szkolenie pokładowego personelu aeromedycznego SZ RP z zakresu stosowania technik linowych w ratownictwie lotniczym;
• szkolenia SERE poziomu A, B oraz B i C "VIP";
• turnusy rehabilitacyjne dla rodzin żołnierzy, którzy ponieśli śmierć podczas wykonywania obowiązków służbowych.

Dodatkowo organizuje bądź współorganizuje:

• Mistrzostwa Sił Powietrznych w narciarstwie zjazdowym;
• Mistrzostwa Wojska Polskiego w pływaniu;
• Mundurowy Dzień Dziecka w Rabce Zdroju;
• Podhalański Konkurs Piosenki Patriotycznej i Wojskowej w Rabce Zdroju.